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Catalogue sous-programme

Répertoire des programmes 2026 > Génétique et Maladies héréditaires > Séquençage de nouvelle génération (SNG/NGS) - Variabilité nombre de copies
Séquençage de nouvelle génération (SNG/NGS) - Variabilité nombre de copies
Ce programme est offert sur invitation seulement.
Génétique et Maladies héréditaires
Année 2026
03-NGSG-CNV-26
EMQN Essai pilote

Fréquence :
Type d'entités et volume :
1 X par an
1 Tubes, 1-2 µg
1 Ensemble de données virtuelles
Analyses demandées :

Recherche de variants de plus de 50bp par SNG (CNV).

Matrices :
ADN génomique (tampon TE)
Analytes évalués :
Précision du génotypage CNV - NGS
Type de résultats évalués :
Qualitatifs
Objectifs du sous-programme :

Évaluer le processus analytique, ainsi que la qualité des données bioinformatiques des participants lorsqu'ils effectuent une recherche de variation du nombre de copies (CNV) par séquençage de nouvelle génération (SNG/NGS).

Spécifications :

Essai pilote. Ce programme est offert sur invitation seulement.

Les participants recevront un cas clinique fictif avec échantillon d’ADN génomique correspondant.

Conçu spécifiquement pour les laboratoires effectuant des analyses de variants de la lignée germinale basés sur NGS UNIQUEMENT.

Les participants doivent analyser les entités reçues selon leur algorithme de routine et soumettre les fichiers suivants pour évaluation :

  • VCF
  • BED
  • FASTQ
  • BAM

Il est possible de soumettre jusqu'à deux séries de données CNV par participation.

Détermination des valeurs assignées :
Valeurs connues, avec des résultats déterminés par une formulation spécifique de l'entité soumise à l'essai d'aptitude.
Paramètres et principes analytiques potentiellement couverts :
Paramètres analytiques Principes analytiques
50055 - Analyse chromosomique pour détection des variations du nombre de copies (CNV) (par CGH, SNG ou autres) Hybridation génomique comparative (CGH)
Séquençage du génome à faible profondeur (LP-WGS)
Séquençage à haut débit

Calendrier 2026

Campagne Ouverture Fermeture
A 2026-09-01 2026-11-27
Analytes Précision du génotypage CNV - NGS
Date d'approbation : 2025-09-19